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UR1164 URGI Unité de Recherche Génomique-Info
- Complément d'adresse :
INRAE RD 10
- Route de Afficher la suite
INRAE RD 10
- Route de Saint-Cyr 78026 VERSAILLES CEDEX Réduire

- Missions :
L'unité de recherche Génomique-Info, créée début 2002, a les objectifs suivants : - conception, Afficher la suite
L'unité de recherche Génomique-Info, créée début 2002, a les objectifs suivants : - conception, développement et mise en oeuve d'un système d'information génomique pour la biologie végétale à l'INRA ; - développement des bases de données et interfaces d'accès à celles-ci, intégration des données, mise en place de pipelines pour l'analyse des données à haut-débit, installation d'outils d'analyse à l'usage des biologistes ; - effectuer des recherches sur la dynamique et l'évolution des génomes ; - exploitation et support de l'environnement développé pour aider les équipes qui produisent ou analysent les données de génomique ; - veille technologique dans le domaine de la bioinformatique ; - dissémination de l'information et de l'expertise vers les différentes équipes de l'INRA et participation à la coordination des activités nationales dans ce domaine. L'unité travaille aujourd'hui principalement sur les thématiques suivantes : - annotation des génomes et intégration de ces données. - intégration, analyse et annotation haut-débit des données d'ESTs et de séquences génomiques. - intégration et analyse des données de cartographie. - intégration et analyse des données de transcriptome issues des puces à ADN. - intégration et analyse des données de polymorphisme et de variabilité allèlique (SNPs). - intégration et analyse des données de protéome ; - intégration des données sur les collections de ressources génétiques. Elle maintient un site web Réduire

- Moyens :
L'unité comprend actuellement une vingtaine de personnes, essentiellement des ingénieurs, dont une Afficher la suite
L'unité comprend actuellement une vingtaine de personnes, essentiellement des ingénieurs, dont une dizaine de permanents. Réduire

- Collaborations :
L'unité est fortement impliquée dans les programmes Génoplante puisqu'elle est la plate-forme Afficher la suite
L'unité est fortement impliquée dans les programmes Génoplante puisqu'elle est la plate-forme bioinformatique publique de Génoplante. Dans ce cadre, ses partenaires privilégiés sont les équipes bioinformatiques de Biogemma et de Bayer CropScience. Elle a également noué de nombreuses collaborations avec d'autres unités impliquées dans Génoplante pour la réalisation de bases de données ou d'outils sur différentes thématiques, en particulier avec l'INRA de Versailles (SNP), l'INRA de Montpellier (protéome), l'URGV (transcriptome). Enfin, elle collabore a de nombreux projets internationaux. Réduire

- Mot(s) clé(s) :
Objet d'étude : espèce végétale, plant, plante
Question sociétale et finalité, contexte : intérêt scientifique
Démarche, discipline : Bioinformatics, génomique
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Objet d'étude : espèce végétale, plant, plante
Question sociétale et finalité, contexte : intérêt scientifique
Démarche, discipline : Bioinformatics, génomique
Echelle d'étude : genome, génome
Dispositif technique et méthode d'étude : génétique d'association
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