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Plateforme Bioinformatique du GénoToul
(ACS)
- Mot(s) clé(s) :
Démarche, discipline : informatique
Dispositif technique et méthode d'étude : bioinformatique
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Démarche, discipline : informatique
Dispositif technique et méthode d'étude : bioinformatique
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- Description détaillée :
La plateforme bioinformatique est l'une des plateformes du GIS Genotoul. Elle a été labellisée RIO respectivement en 2003 et 2006. Depuis 2009, elle bénéficie des labels IBISA et CNOC. Elle est certifiée ISO9001 depuis 2010. Son domaine d'activité est centré sur l'analyse de séquences.



Les prestations offertes incluent l'accès à :


- l'espace de stockage (environ 80 To) et la puissance de calcul apportée par les serveurs et le cluster de calcul (environ 400 coeurs) ; l'accès à cette infrastructure nécessite de disposer d'un compte utilisateur ;

- des banques de données généralistes ;

- des logiciels bio-informatiques de base et spécifiques ;

- l'hébergement de projets (demander l'hébergement d'un projet) ;

- la formation ;

- l'accompagnement des programmes de biologie : traitement de données, développement d'outils...



L'expertise disponible et l'analyse des besoins actuels nous ont conduit à investir de manière prioritaire dans le traitement des données issues des nouvelles techniques de séquençage et sur la détection et l'annotation des ARN non codant.

Depuis 2008, la plate-forme est engagée dans un partenariat avec la plate-forme génomique pour le traitement et la mise à disposition des séquences produites localement. Réduire

- Champs de rattachement :
 

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