PHASE-CT4 :
Ancien CT4 Dynamique d'élaboration des tissus et produits animaux
(CT)
(CT)
- Animateur principal
- Adresse
- Téléphone
- Fax
- Site Web http://www.inra.fr/phase
-
Départements
Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage
- Mot(s) clé(s) :
Objet d'étude :
fibre musculaire,
ovin,
tissu adipeux,
adipocytes,
leptine,
protéome,
ostéoclaste,
monocyte,
noyau,
volaille,
macrophage,
myoblaste,
mitochondrie,
souris,
caille,
dinde,
pintade,
canard,
foie gras,
oiseau domestique,
cellule épithéliale mammaire,
appareil de golgi,
brebis,
chèvre,
vache,
mamelle,
corps jaune,
muscle squelettique,
tissu adipeux blanc,
cellule souche adulte,
cellule satellite,
transplantation cellulaire,
fourrage,
graine oléagineuse,
viande bovine,
système nerveux central,
oryzias latipes,
ciona intestinalis,
porc,
adipocyte,
oie,
abats,
cheval,
cellule souche embryonnaire,
embryon,
vache laitière,
caséine,
arn messager,
ruminant,
intestin,
foie,
veau,
taurillon,
bouvillon,
agneau,
mouton,
génotype,
herbe,
oiseau,
poulet,
poisson,
hypophyse,
muscle,
texture,
tilapia,
oreochromis,
salmonidae,
viande,
protéine recombinante,
bovin,
caprin,
glande mammaire,
transcriptome,
service,
séquençage,
aliment fonctionnel,
poule,
oviducte,
oeuf,
coquille,
albumen
Question sociétale et finalité, contexte : santé humaine, nutrition animale, hygiène, sécurité alimentaire
Démarche, discipline : Base de données, Biotechnologie, biologie moléculaire, Physiologie, Génétique, Bio-informatique
Afficher la suite
Question sociétale et finalité, contexte : santé humaine, nutrition animale, hygiène, sécurité alimentaire
Démarche, discipline : Base de données, Biotechnologie, biologie moléculaire, Physiologie, Génétique, Bio-informatique
Afficher la suite
Objet d'étude :
fibre musculaire,
ovin,
tissu adipeux,
adipocytes,
leptine,
protéome,
ostéoclaste,
monocyte,
noyau,
volaille,
macrophage,
myoblaste,
mitochondrie,
souris,
caille,
dinde,
pintade,
canard,
foie gras,
oiseau domestique,
cellule épithéliale mammaire,
appareil de golgi,
brebis,
chèvre,
vache,
mamelle,
corps jaune,
muscle squelettique,
tissu adipeux blanc,
cellule souche adulte,
cellule satellite,
transplantation cellulaire,
fourrage,
graine oléagineuse,
viande bovine,
système nerveux central,
oryzias latipes,
ciona intestinalis,
porc,
adipocyte,
oie,
abats,
cheval,
cellule souche embryonnaire,
embryon,
vache laitière,
caséine,
arn messager,
ruminant,
intestin,
foie,
veau,
taurillon,
bouvillon,
agneau,
mouton,
génotype,
herbe,
oiseau,
poulet,
poisson,
hypophyse,
muscle,
texture,
tilapia,
oreochromis,
salmonidae,
viande,
protéine recombinante,
bovin,
caprin,
glande mammaire,
transcriptome,
service,
séquençage,
aliment fonctionnel,
poule,
oviducte,
oeuf,
coquille,
albumen
Question sociétale et finalité, contexte : santé humaine, nutrition animale, hygiène, sécurité alimentaire
Démarche, discipline : Base de données, Biotechnologie, biologie moléculaire, Physiologie, Génétique, Bio-informatique
Echelle d'étude : composition corporelle, race, fréquence de traite, chaîne alimentaire, matrice environnementale, environnement
Dispositif technique et méthode d'étude : génomique fonctionnelle, biologie intégrative, suppresseur de tumeur, aquaculture, abattage, microscopie optique, microscopie électronique, hybridation in situ, hybridation in toto, analyse d'image, immunofluorescence, traite, machine à traire, tétée, in vivo, in vitro, culture primaire, thérapie cellulaire, pcr, clonage, technique d'élevage, modélisation empirique, ingénierie des protéines, modélisation, modèle, gène, acide gras du lait, perfusion digestive, système expert, croissance, aviculture, sélection, engraissement, lapin, matrice extracellulaire, isolateur, lactation, élevage, analyse du transcriptome, aquaculture continentale, domestication, système aquacole, utérus, conservation
Composé chimique, Facteur du milieu : collagène, hormone stéroïdienne, vitamine d, cytosquelette, plexine, triiodothyronine, récepteur, coactivateur, oncogène, myopathie, btg1, c-jun, ppar, facteur myogénique, caroténoïde, stéroïde, chromatine, glycogène, phospholipide, cytologie, sécrétion, endocytose, acide gras polyinsaturé, polymorphisme, vésicule de sécrétion, phospholipase, fertilité, ocytocine, myosine, sfrps, enzyme lipogénique, acide linoléique conjugué, transfert de gène, méganucléase, structure primaire, protéine, facteur de transcription, récepteur hormonal, différenciation cellulaire, hormone thyroïdienne, hormone, acide aminé, glucose, acide gras volatil, lipide, lactose, isotope stable, lipoprotéines, agpi, cla, hormone de croissance, facteur de croissance, propriété rhéologique, gonadotropine, insuline, igf, lait, hormone lactogène, prolactine, protéine acide du lactosérum, acide gras, température, métabolite, peptide, jaune d'oeuf
Phénomène, processus et fonction : bourgeonnement cellulaire, formation des os, fragilité des os, pathologie, fusion cellulaire, transformation cellulaire, biogenèse mitochondriale, import mitochondrial, transcription, carcasse, surpoids, développement biologique, métabolisme lipidique, métabolisme énergétique, cellularité, oxydation, stress, rétention d'eau, ph, transport intracellulaire, transduction, exocytose, éjection du lait, plasticité, régulation hormonale, développement, stéatose, développement musculaire, prolifération, métabolisme des nutriments, structure secondaire, structure tertiaire, totipotence, prolifération cellulaire, composition du lait, qualité technologique, métabolisme mammaire, besoin nutritionnel, partition des nutriments, débit sanguin, différence artérioveineuse, régulation, digestion, différenciation, qualité, flaveur, propriété organoleptique, myogenèse, alimentation, transfert de gènes, vecteur d'expression, expression des gènes, qualité du lait, qualité de la chair, pigmentation, croissance musculaire, bio transformation, activité biologique
Réduire
Question sociétale et finalité, contexte : santé humaine, nutrition animale, hygiène, sécurité alimentaire
Démarche, discipline : Base de données, Biotechnologie, biologie moléculaire, Physiologie, Génétique, Bio-informatique
Echelle d'étude : composition corporelle, race, fréquence de traite, chaîne alimentaire, matrice environnementale, environnement
Dispositif technique et méthode d'étude : génomique fonctionnelle, biologie intégrative, suppresseur de tumeur, aquaculture, abattage, microscopie optique, microscopie électronique, hybridation in situ, hybridation in toto, analyse d'image, immunofluorescence, traite, machine à traire, tétée, in vivo, in vitro, culture primaire, thérapie cellulaire, pcr, clonage, technique d'élevage, modélisation empirique, ingénierie des protéines, modélisation, modèle, gène, acide gras du lait, perfusion digestive, système expert, croissance, aviculture, sélection, engraissement, lapin, matrice extracellulaire, isolateur, lactation, élevage, analyse du transcriptome, aquaculture continentale, domestication, système aquacole, utérus, conservation
Composé chimique, Facteur du milieu : collagène, hormone stéroïdienne, vitamine d, cytosquelette, plexine, triiodothyronine, récepteur, coactivateur, oncogène, myopathie, btg1, c-jun, ppar, facteur myogénique, caroténoïde, stéroïde, chromatine, glycogène, phospholipide, cytologie, sécrétion, endocytose, acide gras polyinsaturé, polymorphisme, vésicule de sécrétion, phospholipase, fertilité, ocytocine, myosine, sfrps, enzyme lipogénique, acide linoléique conjugué, transfert de gène, méganucléase, structure primaire, protéine, facteur de transcription, récepteur hormonal, différenciation cellulaire, hormone thyroïdienne, hormone, acide aminé, glucose, acide gras volatil, lipide, lactose, isotope stable, lipoprotéines, agpi, cla, hormone de croissance, facteur de croissance, propriété rhéologique, gonadotropine, insuline, igf, lait, hormone lactogène, prolactine, protéine acide du lactosérum, acide gras, température, métabolite, peptide, jaune d'oeuf
Phénomène, processus et fonction : bourgeonnement cellulaire, formation des os, fragilité des os, pathologie, fusion cellulaire, transformation cellulaire, biogenèse mitochondriale, import mitochondrial, transcription, carcasse, surpoids, développement biologique, métabolisme lipidique, métabolisme énergétique, cellularité, oxydation, stress, rétention d'eau, ph, transport intracellulaire, transduction, exocytose, éjection du lait, plasticité, régulation hormonale, développement, stéatose, développement musculaire, prolifération, métabolisme des nutriments, structure secondaire, structure tertiaire, totipotence, prolifération cellulaire, composition du lait, qualité technologique, métabolisme mammaire, besoin nutritionnel, partition des nutriments, débit sanguin, différence artérioveineuse, régulation, digestion, différenciation, qualité, flaveur, propriété organoleptique, myogenèse, alimentation, transfert de gènes, vecteur d'expression, expression des gènes, qualité du lait, qualité de la chair, pigmentation, croissance musculaire, bio transformation, activité biologique
Réduire
- Description détaillée :
L'ambition de ce champ thématique est d'aborder conjointement l'analyse des mécanismes biologiques Afficher la suite
L'ambition de ce champ thématique est d'aborder conjointement l'analyse des mécanismes biologiques et métaboliques impliqués dans l'élaboration des cellules et des tissus, et contribuant directement ou indirectement à l'élaboration des produits animaux. Ces phénomènes doivent être appréhendés dans leur ensemble, depuis les phases les plus précoces du développement (cellules souches) jusqu'à la maîtrise de la croissance, de la lactation et de la production d'oeufs, en relation avec la qualité des produits, afin d'espérer comprendre, puis maîtriser les flux relatifs et les processus de transformations qui conditionnent l'élaboration et la synthèse des tissus d'intérêt et des produits animaux. Cette appréhension globale nécessite aussi une approche fine de l'expression des gènes et de la régulation de cette expression dans les tissus considérés. Les données obtenues dans ce CT sur l'élaboration et le fonctionnement des tissus constitueront une base de données importante pour la modélisation.
Ce champ thématique est un des « pivots » de l'activité scientifique du département, puisqu'il est lié aux CT1, CT2, CT3 et CT5. C'est celui qui rassemble le plus de chercheurs.
Comme pour les autres CTs, les sous-champs n'ont qu'une valeur descriptive. Ils sont organisés afin de décrire les dynamiques proposées depuis la différenciation initiale des tissus jusqu'à la caractérisation des tissus et produits animaux.
Le premier sous-champ regroupe l'analyse de tous les mécanismes à l'origine de la multiplication, de la différenciation et du développement cellulaires, jusqu'à l'établissement d'un phénotype cellulaire et/ou tissulaire différencié. Y sont traités les programmes relevant des cellules souches, des précurseurs tissulaires, de l'implication des systèmes protéolytiques et des mécanismes de dédifférenciation et régénération nerveuse et musculaire.
Notre place est assez modeste malgré quelques secteurs d'excellence, surtout du fait de l'existence d'une compétition très importante, même au niveau national, avec des programmes de biologie fondamentale ou de l'importance des objectifs de thérapie humaine. Certains thèmes en émergence, partagés avec d'autres (UMR et USC Cnrs ou Université) sont originaux et devraient améliorer notre place (cellules ES de poulet et mammifères ; gènes impliqués dans le développement du système nerveux ou le développement musculaire chez le poisson, implication des protéases Ca-dépendantes dans la différenciation musculaire). Notre relative faiblesse réside aussi dans l'effectif de chercheurs et techniciens, dans notre implication insuffisante dans certaines UMR et dans le manque de coordination intra et inter-unités sur ces thèmes. Du fait de son importance en biologie fondamentale, des perspectives de thérapie humaine et de la compétition mondiale, ce thème est très présent au niveau européen et la compétition y est extrêmement forte (cellules souches, mécanismes de différenciation et de dédifférenciation).
Le second sous-champ, s'intéresse aux relations entre la structure et les propriétés fonctionnelles des protéines dans les tissus vivants, qui constitue un aspect absolument essentiel pour comprendre les bases de leurs actions biologiques et de la communication entre cellules et/ou entre tissus vivants (alors que CEPIA s'intéresse à l'organisation supra-moléculaire des produits : biologie structurale). La compréhension de ces mécanismes est aussi un enjeu fondamental pour les approches de protéomique (voir Biologie Intégrative). Sont traitées en particulier, les questions liées à la prédiction des structures spatiales (repliements), aux maturations post-traductionnelles et aux interactions entre protéines (liaisons hormones- récepteurs).
Les équipes ont une bonne position dans certains créneaux bien ciblés (hormones glycoprotéiques, prédiction des repliements), mais n'ont pas une place importante au niveau général, du fait de leur relative petite taille et du très grand nombre d'équipes travaillant sur ces sujets très généraux en France, en Europe et dans le Monde.
Le troisième sous-champ traite de la mise en place, de l'organisation et du métabolisme tissulaires. En prolongement des travaux sur le développement embryonnaire précoce (CT2.3) et cellulaire (CT4.1), il s'intéresse aux premières étapes de l'organogenèse, puis aux différents tissus constitutifs des produits animaux ou d'une importance cruciale pour la production de ceux-ci. L'enjeu est ici de coordonner les travaux sur le développement, la différenciation et le métabolisme des principaux tissus effecteurs des productions (muscle, tissu adipeux, mamelle, ovaire et oviducte pour l'oeuf), des organes relais (système digestif et foie) et régulateurs (système nerveux), sans oublier la régulation des flux inter-organes de nutriments. Ce domaine est très exploré ailleurs, compte tenu des enjeux physiopathologiques qui s'y rattachent pour l'espèce humaine. Nos forces sont importantes dans ce domaine (sauf sur la régulation des flux inter-organes). Notre positionnement européen et mondial est en progrès, car bien engagé (réseaux et programmes) sur mitochondries, oeuf, cellules mammaires, et en cours de consolidation sur le muscle (projet PI 2004 sur la viande bovine, réseau Cost 2004 sur la croissance prénatale chez le porc, etc ?). Nous devrions sensiblement améliorer notre place en favorisant une meilleure coordination interne, intra et inter départements, sur quelques sujets prioritaires (ex. tissu adipeux intra-musculaire). Enfin, les conditions du développement des larves, notamment sous l'influence de l'alimentation, problème très spécifique des poissons mais dont les principes généraux pourraient intéresser d'autres ordres, est un domaine où nous avons une bonne place mondiale, reconnuegrâce à la mise au point d'un aliment inerte pour larves des poissons d'eau douce et d'eau de mer.
Le dernier sous-champ est consacré à la maîtrise de la croissance, de la lactation et de la production d'oeufs pour la qualité des produits ; il vise à explorer la construction de la qualité en élevage.
Nous sommes dans une bonne position dominante en France et en Europe sur la maîtrise des conditions de production (ex. programmes laitiers dans l'ouest, le centre et l'est), sur la viande et le lait des ruminants et sur la chair des poissons (réseaux et programmes européens). Cette position est plus faible sur les monogastriques (pas encore de participation à des actions européennes). Notre expertise en nutrition nous amène à poursuivre la conduite d'un thème émergent sur la traçabilité de microconstituants et xénobiotiques, de l'alimentation animale au produit, pour répondre à une demande pressante des consommateurs ; nous estimons y être très compétitifs au plan international, dans un secteur très concurrentiel au niveau mondial. Plus globalement, nous pensons qu'il faut continuer à soutenir ce secteur et coordonner réellement nos travaux avec CEPIA (ex. micelles de caséines, globules gras du lait, fibres musculaires) si nous voulons conserver notre place.
Réduire
Ce champ thématique est un des « pivots » de l'activité scientifique du département, puisqu'il est lié aux CT1, CT2, CT3 et CT5. C'est celui qui rassemble le plus de chercheurs.
Comme pour les autres CTs, les sous-champs n'ont qu'une valeur descriptive. Ils sont organisés afin de décrire les dynamiques proposées depuis la différenciation initiale des tissus jusqu'à la caractérisation des tissus et produits animaux.
Le premier sous-champ regroupe l'analyse de tous les mécanismes à l'origine de la multiplication, de la différenciation et du développement cellulaires, jusqu'à l'établissement d'un phénotype cellulaire et/ou tissulaire différencié. Y sont traités les programmes relevant des cellules souches, des précurseurs tissulaires, de l'implication des systèmes protéolytiques et des mécanismes de dédifférenciation et régénération nerveuse et musculaire.
Notre place est assez modeste malgré quelques secteurs d'excellence, surtout du fait de l'existence d'une compétition très importante, même au niveau national, avec des programmes de biologie fondamentale ou de l'importance des objectifs de thérapie humaine. Certains thèmes en émergence, partagés avec d'autres (UMR et USC Cnrs ou Université) sont originaux et devraient améliorer notre place (cellules ES de poulet et mammifères ; gènes impliqués dans le développement du système nerveux ou le développement musculaire chez le poisson, implication des protéases Ca-dépendantes dans la différenciation musculaire). Notre relative faiblesse réside aussi dans l'effectif de chercheurs et techniciens, dans notre implication insuffisante dans certaines UMR et dans le manque de coordination intra et inter-unités sur ces thèmes. Du fait de son importance en biologie fondamentale, des perspectives de thérapie humaine et de la compétition mondiale, ce thème est très présent au niveau européen et la compétition y est extrêmement forte (cellules souches, mécanismes de différenciation et de dédifférenciation).
Le second sous-champ, s'intéresse aux relations entre la structure et les propriétés fonctionnelles des protéines dans les tissus vivants, qui constitue un aspect absolument essentiel pour comprendre les bases de leurs actions biologiques et de la communication entre cellules et/ou entre tissus vivants (alors que CEPIA s'intéresse à l'organisation supra-moléculaire des produits : biologie structurale). La compréhension de ces mécanismes est aussi un enjeu fondamental pour les approches de protéomique (voir Biologie Intégrative). Sont traitées en particulier, les questions liées à la prédiction des structures spatiales (repliements), aux maturations post-traductionnelles et aux interactions entre protéines (liaisons hormones- récepteurs).
Les équipes ont une bonne position dans certains créneaux bien ciblés (hormones glycoprotéiques, prédiction des repliements), mais n'ont pas une place importante au niveau général, du fait de leur relative petite taille et du très grand nombre d'équipes travaillant sur ces sujets très généraux en France, en Europe et dans le Monde.
Le troisième sous-champ traite de la mise en place, de l'organisation et du métabolisme tissulaires. En prolongement des travaux sur le développement embryonnaire précoce (CT2.3) et cellulaire (CT4.1), il s'intéresse aux premières étapes de l'organogenèse, puis aux différents tissus constitutifs des produits animaux ou d'une importance cruciale pour la production de ceux-ci. L'enjeu est ici de coordonner les travaux sur le développement, la différenciation et le métabolisme des principaux tissus effecteurs des productions (muscle, tissu adipeux, mamelle, ovaire et oviducte pour l'oeuf), des organes relais (système digestif et foie) et régulateurs (système nerveux), sans oublier la régulation des flux inter-organes de nutriments. Ce domaine est très exploré ailleurs, compte tenu des enjeux physiopathologiques qui s'y rattachent pour l'espèce humaine. Nos forces sont importantes dans ce domaine (sauf sur la régulation des flux inter-organes). Notre positionnement européen et mondial est en progrès, car bien engagé (réseaux et programmes) sur mitochondries, oeuf, cellules mammaires, et en cours de consolidation sur le muscle (projet PI 2004 sur la viande bovine, réseau Cost 2004 sur la croissance prénatale chez le porc, etc ?). Nous devrions sensiblement améliorer notre place en favorisant une meilleure coordination interne, intra et inter départements, sur quelques sujets prioritaires (ex. tissu adipeux intra-musculaire). Enfin, les conditions du développement des larves, notamment sous l'influence de l'alimentation, problème très spécifique des poissons mais dont les principes généraux pourraient intéresser d'autres ordres, est un domaine où nous avons une bonne place mondiale, reconnuegrâce à la mise au point d'un aliment inerte pour larves des poissons d'eau douce et d'eau de mer.
Le dernier sous-champ est consacré à la maîtrise de la croissance, de la lactation et de la production d'oeufs pour la qualité des produits ; il vise à explorer la construction de la qualité en élevage.
Nous sommes dans une bonne position dominante en France et en Europe sur la maîtrise des conditions de production (ex. programmes laitiers dans l'ouest, le centre et l'est), sur la viande et le lait des ruminants et sur la chair des poissons (réseaux et programmes européens). Cette position est plus faible sur les monogastriques (pas encore de participation à des actions européennes). Notre expertise en nutrition nous amène à poursuivre la conduite d'un thème émergent sur la traçabilité de microconstituants et xénobiotiques, de l'alimentation animale au produit, pour répondre à une demande pressante des consommateurs ; nous estimons y être très compétitifs au plan international, dans un secteur très concurrentiel au niveau mondial. Plus globalement, nous pensons qu'il faut continuer à soutenir ce secteur et coordonner réellement nos travaux avec CEPIA (ex. micelles de caséines, globules gras du lait, fibres musculaires) si nous voulons conserver notre place.
Réduire
- Champs de rattachement :
- Biologie des transports cellulaires (ACR)
- Contrôle de la prolifération et de la différenciation des cellules souches embryonnaires. Rôle des récepteurs nucléaires de l'hormone thyroïdienne (ACR)
- Morphogenèse du système nerveux des chordés (ACR)
- Transduction des signaux hormonaux et activation du génome dans la glande mammaire (ACR)