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Taxinomie et phylogénie des bactéries et nématodes entomopathogènes
(ACR)
- Mot(s) clé(s) :
Objet d'étude : heterorhabditis, photorhabdus, steinernema, xenorhabdus
Question sociétale et finalité, contexte : biodiversité génétique
Démarche, discipline : bactériologie, biochimie, biologie moléculaire
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Objet d'étude : heterorhabditis, photorhabdus, steinernema, xenorhabdus
Question sociétale et finalité, contexte : biodiversité génétique
Démarche, discipline : bactériologie, biochimie, biologie moléculaire
Dispositif technique et méthode d'étude : gnotoxénie, hybridation adn adn, phylogénie, physiologie microbienne, séquençage de gènes, séquençage du génome, taxinomie
Composé chimique, Facteur du milieu : sol agricole, sol alluvial
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- Description détaillée :
Ces travaux ont été développés à travers une collaboration féconde entre N. Boemare en France et Afficher la suite
Ces travaux ont été développés à travers une collaboration féconde entre N. Boemare en France et R.J. Akhurst en Australie [1]. Les résultats des travaux de caractérisation phénotypique et moléculaire du laboratoire ont contribué à la définition du genre Photorhabdus [2], de ses trois espèces et de plusieurs des sous-espèces décrites à ce jour [3,9,12], ainsi qu’à la caractérisation de plus d'une dizaine d’espèces nouvelles de Xenorhabdus [4,9,10].

Nos collaborations avec d'autres équipes de recherche en France comme à l'étranger [5,6,8,11] ainsi qu'avec les Centres techniques agricoles nous conduisent à mener des campagnes de collecte de nématodes entomopathogènes et à intégrer, dans notre démarche, des bio-essais visant à mieux caractériser les performances des différentes populations de nématodes en fonction des insectes cibles testés.

L'équipe gère une collection de plus de 200 souches bactériennes provenant de nématodes issus de tous les continents (sauf l’Antarctique) et enrichit régulièrement sa collection de nématodes par des collectes locales [6] et à travers des collaborations :

- nationales notamment avec les Centres techniques agricoles intéressés par l'utilisation de nouveaux moyens de lutte biologique contre les insectes ravageurs de cultures et,
- internationales et en particulier avec des partenaires qui s'intéressent à collecter et caractériser des nématodes entomopathogènes [5,8,10,11,12]

Ces ressources biologiques (notamment les molécules antimicrobiennes [7] et les toxines insecticides produites par Photorhabdus et Xenorhabdus) sont valorisées à travers des contrats industriels.



[12]. FERREIRA T, VAN REENEN C, PAGES S, TAILLIEZ P, MALAN AP, DICKS LMT. 2013. Description of Photorhabdus luminescens subsp. noenieputensis subsp. nov., a symbiotic bacterium associated with a new Heterorhabditis species related to Heterorhabditis indica. Int J Syst Evol Microbiol. 63:1853-1858. Epub 2012 Sept 14.

[11]. NOUJEIM E, KHATER C, PAGES S, OGIER JC, TAILLIEZ P, HAMZE M, THALER O. 2011. The first record of entomopathogenic nematodes (Rhabiditiae: Steinernematidae and Heterorhabditidae) in natural ecosystems in Lebanon: A biogeographic approach in the Mediterranean region. J Invertebr Pathol. 107:82-85. Epub 2011 Jan 15.

[10]. TAILLIEZ P, PAGES S, EDGINGTON S, TYMO LM, BUDDIE AG. 2011. Description of Xenorhabdus magdalenensis sp. nov., the bacterium associated with Steinernema australe. Int J Syst Evol Microbiol. 62:1761-1765. Epub 2011. Sept 23.

[9]. TAILLIEZ P, LAROUI C, GINIBRE N, PAULE A, PAGES S, BOEMARE N. 2010. Phylogeny of Photorhabdus and Xenorhabdus based on universally conserved protein-coding sequences and implications for the taxonomy of these two genera. Proposal of new taxa: X. vietnamensis sp. nov., P. luminescens subsp. caribbeanensis subsp. nov., P. luminescens subsp. hainanensis subsp. nov., P. temperata subsp. khanii subsp. nov., P. temperata subsp. tasmaniensis subsp. nov., and the reclassification of P. luminescens subsp. thracensis as P. temperata subsp. thracensis. Int J Syst Evol Microbiol. 60:1921-1937. Epub 2009 Sep 25.

[8]. CAMPOS-HERRERA, TAILLIEZ P, PAGES S, GINIBRE N, GUTIERREZ C, BOEMARE NE. 2009. Characterization of Xenorhabdus isolates from La Rioja (Northern Spain) and virulence with and without their symbiotic entomopathogenic nematodes (Nematoda: Steinernematidae). J Invertebr Pathol. 102:173-181.

[7]. GUALTIERI M, AUMELAS A, THALER J-O. 2009. Identification of a new antimicrobial lysine-rich cyclolipopeptide family from Xenorhabdus nematophila. J Antibiotics. 62:295-302.

[6]. EMELIANOFF V, LE BRUN N, PAGES S, STOCK SP, TAILLIEZ P, MOULIA C, SICARD M. 2008. Isolation and identification of entomopathogenic nematodes and their symbiotic bacteria from Hérault and Gard (Southern France). J Invertebr Pathol. 98:211-217.

[5]. MRACEK Z, NGUYEN KB, TAILLIEZ P, BOEMARE N, CHEN S. 2006. Steinernema sichuanense n. sp. (Rhabditida, Steinernematidae), a new species of entomopathogenic nematode from the province of Sichuan, east Tibetan Mts., China. J Invertebr Pathol. 93:157-169.

[4]. TAILLIEZ P, PAGES S, GINIBRE N, BOEMARE N. 2006. New insight into diversity in the genus Xenorhabdus, including the description of ten novel species. Int J Syst Evol Microbiol. 56:2805-2818.

[3]. FISCHER-LE SAUX M, VIALLARD V, BRUNEL B, NORMAND P, BOEMARE NE. 1999. Polyphasic classification of the genus Photorhabdus and proposal of new taxa: P. luminescens subsp. luminescens subsp. nov., P. luminescens subsp. akhurstii subsp. nov., P. luminescens subsp. laumondii subsp. nov., P. temperata sp. nov., P. temperata subsp. temperata subsp. nov. and P. asymbiotica sp. nov. Int J Syst Bacteriol. 49:1645-1656.

[2]. BOEMARE NE, AKHURST RJ, BAUD L, MOURANT RG. 1993. DNA relatedness between Xenorhabdus spp. (Enterobacteriaceae), symbiotic bacteria of entomopathogenic nematodes and a proposal to transfer Xenorhabdus luminescens to a new genus, Photorhabdus gen. nov. Int J Syst Bacteriol. 43:249-255.

[1]. AKHURST RJ, BOEMARE NE. 1988. A numerical taxonomic study of the genus Xenorhabdus (Enterobacteriaceae) and proposed elevation of the subspecies of X. nematophilus to species. J Gen Microbiol. 134:1835-1845. Réduire

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