MICA-CT3 :
de la caractérisation des écosystèmes à leur analyse fonctionnelle et leur maitrise
(CT)
(CT)
- Animateur principal Emmanuelle Maguin
- Adresse INRA Domaine de Vilvert 78352 Jouy-En-Josas
- Téléphone +33 (0) 1 34 65 25 18
- Fax 01 34 65 27 27
- E-mail Emmanuelle.Maguin [at] jouy.inra.fr
- Site Web http://www.inra.fr/mica
-
Départements
Microbiologie et Chaîne Alimentaire
- Mot(s) clé(s) :
Objet d'étude :
lactococcus lactis,
streptococcus thermophilus,
bactérie lactique,
industrie laitière,
texture,
lactobacillus bulgaricus,
bactériophage,
champignon filamenteux,
streptomyces,
fromage,
flore microbienne,
protéome,
emmental,
pâte pressée cuite,
paroi,
probiotique,
transcriptome,
lactone,
levure,
saccharomyces cerevisiae,
oxygène,
contrôle,
ferment de salaison,
staphylocoque,
saucisson
Démarche, discipline : biologie moléculaire, Cancer, Physiologie, interactions cellulaires
Echelle d'étude : écosystème simple, écosystème, fluxome, microbiote intestinal
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Démarche, discipline : biologie moléculaire, Cancer, Physiologie, interactions cellulaires
Echelle d'étude : écosystème simple, écosystème, fluxome, microbiote intestinal
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Objet d'étude :
lactococcus lactis,
streptococcus thermophilus,
bactérie lactique,
industrie laitière,
texture,
lactobacillus bulgaricus,
bactériophage,
champignon filamenteux,
streptomyces,
fromage,
flore microbienne,
protéome,
emmental,
pâte pressée cuite,
paroi,
probiotique,
transcriptome,
lactone,
levure,
saccharomyces cerevisiae,
oxygène,
contrôle,
ferment de salaison,
staphylocoque,
saucisson
Démarche, discipline : biologie moléculaire, Cancer, Physiologie, interactions cellulaires
Echelle d'étude : écosystème simple, écosystème, fluxome, microbiote intestinal
Dispositif technique et méthode d'étude : génétique formelle, interaction, culture mixte, quorum sensing, fluxomique, fouille de données, taxonomie, physiologie microbienne, microbiologie, bioinformatique, biologie intégrative, oenologie, modélisation, sonde spécifique, ingénierie métabolique, digesteur
Composé chimique, Facteur du milieu : arôme, peptide, oligopeptide, protéine de liaison des oligopeptides, chromosome linéaire, acide gras, composés soufrés, acide aminé, aminotransférase, ester, coopération, propriété antioxydante
Phénomène, processus et fonction : régulation, expression des gènes, crossing over, transposition, réponse stringente, carence nutritionnelle, stress acide, stress biliaire, surexpression, ressource génétique, transport, métabolomique, évolution, métabolisme secondaire, affinage, dynamique des populations, fermentation, stress thermique, stress osmotique, lyse, lysogénie, apoptose, bioconversion, fermentation alcoolique, catabolisme, flaveur, catabolisme des acides aminés
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Démarche, discipline : biologie moléculaire, Cancer, Physiologie, interactions cellulaires
Echelle d'étude : écosystème simple, écosystème, fluxome, microbiote intestinal
Dispositif technique et méthode d'étude : génétique formelle, interaction, culture mixte, quorum sensing, fluxomique, fouille de données, taxonomie, physiologie microbienne, microbiologie, bioinformatique, biologie intégrative, oenologie, modélisation, sonde spécifique, ingénierie métabolique, digesteur
Composé chimique, Facteur du milieu : arôme, peptide, oligopeptide, protéine de liaison des oligopeptides, chromosome linéaire, acide gras, composés soufrés, acide aminé, aminotransférase, ester, coopération, propriété antioxydante
Phénomène, processus et fonction : régulation, expression des gènes, crossing over, transposition, réponse stringente, carence nutritionnelle, stress acide, stress biliaire, surexpression, ressource génétique, transport, métabolomique, évolution, métabolisme secondaire, affinage, dynamique des populations, fermentation, stress thermique, stress osmotique, lyse, lysogénie, apoptose, bioconversion, fermentation alcoolique, catabolisme, flaveur, catabolisme des acides aminés
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- Description détaillée :
L'objectif premier est de connaître les flores associées aux procédés de transformation et Afficher la suite
L'objectif premier est de connaître les flores associées aux procédés de transformation et d'identifier les fonctions exprimées au cours des procédés et leur régulation. L'objectif à long terme est de pouvoir modéliser les comportements en conditions technologiques en intégrant les exigences de qualité et de sûreté.
Les microorganismes concernés sont essentiellement des bactéries lactiques et des champignons (levures, filamenteux), mais de nombreux autres groupes sont également concernés (bactéries propioniques, coryneformes, clostridies, streptomycètes, etc.).
Trois objectifs majeurs ont été définis:
-développer les approches prédictives du comportement microbien en conditions technologiques par l'étude des réponses globales et leur modélisation (system biology),
-comprendre le fonctionnement des flores microbiennes complexes impliquées dans l'élaboration des aliments,
-maintenir une expertise dans le domaine de la qualité des produits et des procédés.
Les partenariats nationaux concernent d'abord le département CEPIA, ensuite les acteurs professionnels ou institutionnels des différentes filières.
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Les microorganismes concernés sont essentiellement des bactéries lactiques et des champignons (levures, filamenteux), mais de nombreux autres groupes sont également concernés (bactéries propioniques, coryneformes, clostridies, streptomycètes, etc.).
Trois objectifs majeurs ont été définis:
-développer les approches prédictives du comportement microbien en conditions technologiques par l'étude des réponses globales et leur modélisation (system biology),
-comprendre le fonctionnement des flores microbiennes complexes impliquées dans l'élaboration des aliments,
-maintenir une expertise dans le domaine de la qualité des produits et des procédés.
Les partenariats nationaux concernent d'abord le département CEPIA, ensuite les acteurs professionnels ou institutionnels des différentes filières.
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- Champs de rattachement :
- Bases mécanistiques de la biodiversité bactérienne et de l'expression phénotypique in situ (ACR)
- Bioadhésion et Biofilms microbiens (ACR)
- CIRM - CRB : Bactéries d'intérêt alimentaire (ACS)
- Dynamique de la structure des entités biologiques (macromolécules / minéraux / microorganismes) et contamination des surfaces solides (ACR)
- Dynamiques Diffusionnelles et Réactionnelles au sein des matrices laitières (ACR)
- Dynamiques et fonctionnalités des écosystèmes microbiens fromagers (ACR)
- Ecologie microbienne et Biodiversité (ACR)
- Génomique fonctionnelle et évolutive des actinomycètes (ACR)
- Interaction EHEC - Chaîne alimentaire (ACR)
- Plateau technique de microscopie (ACS)
- Propriétés de surface des matériaux et dynamique des interfaces (ACR)